Sinüzit, ilaçlar ile tedavi edilemez ise cerrahi olarak sinüsler boşaltılabilir. Daha sonra gelişecek akut sinüzitlerde tedavi geciktirilmemeli ve aksatılmamalıdır.
Sinüslerin kalın iğne ile boşaltılması işlemine ponksiyon denmektedir. Sinüzitin tedavisi antibiyotiklerle yapılır. Ancak antibiyotiğe cevap vermeyen çok ağrılı bloke olmuş sinüzitlerde sinüs boşaltma işlemine başvurabilir. Böylece sinüs boşaltılarak ciddi bir apseleşmenin önüne geçilir.
Yüz ve alın sinüslerine bu işlem yapılabilir. Sinüsün boşaltıldığı deliğe altı gün kadar ince lastik bir tüp konulur. Bu işlem ile sinüslerde tekrar bir birikim olması engellenir.